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Tauchen, Anika: Genexpressionsanalysen zur Charakterisierung primärer Mammatumoren im neoadjuvanten Setting. 2009
Inhalt
Abbildungsverzeichnis
Tabellenverzeichnis
Glossar
Zusammenfassung
Einleitung
Brustkrebsepidemiologie
Diagnose und Therapie des Mammakarzinoms
Brustkrebsforschung - wichtige Studien im Überblick
Prozesse in der Tumorzelle
Ziele der Arbeit
Material und Methoden
Patientinnenkollektiv und Tumorproben
Auswahlkriterien
Patientinnenbezogene Daten
Tumormaterial und Referenz
Tumorbezogene Daten
Themenmikroarray
Geninformation und -sequenzen
Gen-Ontologie
Labormaterial
Lösungen und Puffer
Chemikalien/Sonstiges
Verbrauchsmaterialien
Enzyme
Real-Time-PCR-Primer
Komplett-Systeme (Kits)
Geräte
Software
Methoden
Gesamt-RNA-Isolierung
RNA-Messungen
Mikroarrayhybridisierung
Quantitative Real-Time-PCR
Datenanalyse
Ergebnisse
Erstellung des Themenarrays
Die 70-Gen-Signatur von van't Veer et al.
Weitere brustkrebsassoziierte Gene
Datengrundlage der Analysen
Charakterisierung des Patientinnenkollektivs
Gewonnene Expressionsdaten und ihre Einordnung
RNA aus Tumorgewebe
Charakterisierung anhand von Genexpressionsanalysen
Gene mit gleich bleibender Expression
Gene mit variierender Expression
Identifizierung auffälliger Gengruppen
Klinische Parameter und Genexpressionsdaten
Rangkorrelationsanalysen
Normalized Tree Index
Detaillierte Analysen zu den Hormonrezeptoren
Diskussion
Studiendesign und Methoden
Molekulare Charakterisierung von Brusttumoren
Genexpressionsanalysen in der klinischen Anwendung
Ausblick
Geninformation
Sequenzinformation der 70mer-Oligonukleotide
Gene aus der 70-Gen-Signatur nach van't Veer
Genauswahl des Themenarrays (Literaturrecherche)
Patientinnendaten/klinische Parameter
RNA-Isolierung
Mikroarrayexperimente
Literaturverzeichnis