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Blaesen, Markus: Untersuchungen zur Lyse und Rückführung bakterieller Biomasse als Medienbestandteil in den Fermentationsprozess. 2006
Inhalt
1 Einleitung
1.1 Ziel der Arbeit
2 Theoretischer Hintergrund
2.1 Mikrobielle Biomasseabfälle und deren Entsorgung
2.2 Alternative Wege zur Verwendung mikrobieller Biomasse-abfälle
2.3 Zusammensetzung bakterieller Biomasse
2.4 Zellaufschlussverfahren für den industriellen Maßstab
2.4.1 Zellaufschluss und dessen Messung
2.4.2 Hochdruckaufschluss
2.4.3 Chemische Hydrolyse
2.4.4 Autolyse
2.5 Projektbeschreibungen
2.5.1 Bedeutung von Aminosäuren
2.5.2 Die essentielle Aminosäure L-Threonin
2.5.3 Klassifizierung von Proteasen
2.5.4 Quellen für die Proteasegewinnung
2.5.5 Eigenschaften der alkalischen Proteasen
2.5.6 Einsatz der alkalischen Proteasen
3 Material
3.1 Geräte
3.2 Chemikalien
3.3 Bakterienstämme
3.3.1 Klebsiella planticola
3.3.2 Escherichia coli B-3996
3.3.3 Bacillus licheniformis P300
3.4 Medien und Stammhaltung
3.4.1 Medien zur Kultivierung von Klebsiella planticola
3.4.2 Medien zur Kultivierung von Escherichia coli B-3996
3.4.3 Medien zur Kultivierung von Bacillus licheniformis P300
3.4.4 Stammhaltung
3.5 Bioreaktoren
4 Methoden
4.1 Kultivierungsparameter
4.2 Zellernte
4.3 Fermentationsanalytik
4.3.1 Übersicht
4.3.2 Bestimmung der optischen Dichte
4.3.3 Bestimmung der Biotrockenmassekonzentration
4.3.4 Bestimmung der Zellzahldichte
4.3.5 Bestimmung der segregativen Plasmidstabilität
4.3.6 Enzymatische Glucose- und Saccharosebestimmung
4.3.7 Bestimmung der Glycerinkonzentration
4.3.8 DNS-Methode zur Bestimmung der Konzentration an reduzierenden Zuckern
4.3.9 L-Threonin-Nachweis durch Hochleistungsflüsssigkeits-chromatographie
4.3.10 Bestimmung der α-Aminogruppenkonzentration
4.3.11 Bestimmung der Proteaseaktivität
4.3.12 Bestimmung des Kohlenstoff- und Stickstoffgehaltes
4.3.13 Proteinbestimmung mit dem modifizierten Bradford-Test
4.3.14 Qualitativer Proteinnachweis mittels Disk-SDS-PAGE
4.3.15 Qualitativer Nukleinsäurenachweis
4.4 Lyseverfahren
4.4.1 Lyseversuche im Schüttelkolbenmaßstab
4.4.2 Lysatherstellung für Kultivierungen
4.5 Lysatanalytik
4.5.1 Proteinbestimmung mit dem modifizierten Bradford-Test
4.5.2 Bestimmung der Feststoffkonzentration
4.5.3 Bestimmung der Acetatkonzentration
4.5.4 Bestimmung des Kohlenstoff- und Stickstoffgehaltes
4.5.5 Bestimmung des Aminosäurespektrums
4.5.6 Bestimmung der DNA-Konzentration
4.5.7 Qualitativer Proteinnachweis mittels Disk-SDS-PAGE
5 Ergebnisse und Diskussion - Klebsiella planticola
5.1 Fermentationen zur Biomassegewinnung auf TB-Medium
5.2 Lyseversuche
5.2.1 Ermittlung der optimalen Passagenanzahl und des optimalen Aufschlussdruckes für die Klebsiella planticola-Zellen bei Verwendung des Hochdruckhomogenisators
5.2.2 Autolyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation des pH
5.2.3 Enzymatische Lyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation der Enzymkonzentration
5.2.4 Alkalische und saure Hydrolyse ganzer Zellen
5.2.5 Alkalische und saure Hydrolyse nach Hochdruckaufschluss
5.2.6 Zusammenfassende Betrachtung der Lyseversuche
5.3 Fermentationen von Klebsiella planticola auf einem halbsynthetischen Medium
5.4 Bilanzierungen für die Fermentationen von Klebsiella planticola auf einem halbsynthetischen Medium
5.5 Lysatanalytik
5.6 Fermentationen mit Lysat
5.7 Zusammenfassung
6 Ergebnisse und Diskussion - Escherichia coli B-3996
6.1 Fermentationen zur Biomassegewinnung
6.2 Lyseversuche
6.2.1 Autolyse ganzer Zellen unter Variation des pH
6.2.2 Ermittlung der optimalen Passagenanzahl und des optimalen Aufschlussdruckes für die Escherichia coli-Zellen bei Verwendung des Hochdruckhomogenisators
6.2.3 Autolyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation des pH
6.2.4 Enzymatische Lyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation der Enzymkonzentration
6.2.5 Enzymatische Lyse ohne Hochdruckaufschluss
6.2.6 Enzymatische Lyse mittels zweier Enzyme nach Hochdruckaufschluss
6.2.7 Alkalische und saure Hydrolyse ganzer Zellen
6.2.8 Alkalische und saure Hydrolyse nach Hochdruckaufschluss
6.2.9 Zusammenfassende Betrachtung der Lyseversuche
6.3 Fermentationen von Escherichia coli B-3996 auf dem halbsynthetischen Medium A1-160
6.4 Bilanzierungen für die Fermentationen von Escherichia coli B-3996 auf dem halbsynthetischen Medium A1-160
6.5 Lysatanalytik
6.6 Fermentationen auf dem halbsynthetischen Medium A1-160 mit Lysat
6.7 Rückführung der Biomasse über mehrere Zyklen
6.8 Zusammenfassung
7 Ergebnisse und Diskussion - Bacillus licheniformis P300
7.1 Biomassegewinnung
7.2 Lyseversuche
7.2.1 Ermittlung der optimalen Passagenanzahl und des optimalen Aufschlussdruckes für die Bacillus licheniformis-Zellen bei Verwendung des Hochdruckhomogenisators
7.2.2 Autolyse unter Variation des pH
7.2.3 Autolyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation des pH - Teilversuch 1
7.2.4 Autolyse nach Hochdruckaufschluss unter Variation des pH - Teilversuch 2
7.2.5 Alkalische Hydrolyse ganzer Zellen
7.2.6 Zusammenfassende Betrachtung der Lyseversuche
7.3 Kultivierungen auf dem Produktionsmedium
7.4 Bilanzierungen für die Fermentationen von Bacillus licheniformis P300 auf dem KF-Medium
7.5 Lysatherstellung und -analytik
7.6 Kultivierungen mit Lysat
7.6.1 Ersatz des Maisquellwassers durch Zelllysat
7.6.2 Teilersatz des Sojapeptons
7.7 Zusammenfassung
8 Zusammenfassung
9 Literaturverzeichnis
10 Anhang
10.1 Formelzeichen
10.2 Griechische Formelzeichen
10.3 Indices
10.4 Abkürzungen
10.5 Aminosäurennomenklatur nach IUPAC
10.6 Tabellen
11 Lebenslauf
12 Publikationen