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Klamp, Tobias: Ein schnelles Bead-basiertes und bildgebendes Verfahren zur Quantifizierung von Nukleinsäuren für die Integration in Lab-on-a-Chip-basierten Point-of-Care [...]. 2013
Inhalt
Zusammenfassung
Summary
Abkürzungsverzeichnis
1 Einleitung
1.1 Diagnostik von CA-LRTI Pathogenen, Stand der Technik
1.2 Point-Of-Care-Testing (POCT)
1.3 Detektion und Identifikation von Nukleinsäuren
1.4 Zielsetzung
2 Theoretische Grundlagen
2.1 Prinzipien der Fluoreszenzspektroskopie
2.1.1 Absorption und Emission von Licht
2.1.2 Fluoreszenzmikroskopie
2.2 Nukleinsäuren
2.2.1 Natürliche Nukleinsäuren
2.2.2 Spezielle Formen und Strukturen
3 Material und Methoden
3.1 Ensemble Spektroskopie
3.1.1 Absorptionsspektroskopie
3.1.2 Emissionsspektroskopie
3.2 Fluoreszenz Mikroskopie
3.2.1 Das wissenschaftliche Fluoreszenzmikroskop
3.2.2 Das miniaturisierte Fluoreszenzmikroskop
3.3 Datenanalyse
3.3.1 Datenaufnahme
3.3.2 Bildverarbeitung
3.3.3 Darstellung der Daten
3.4 Benutzte Fragmente
3.5 Probenzubereitung
3.5.1 Allgemeiner Teil
3.5.2 Einzelne Experimente
3.6 Bestimmung des SCRs bei Zweifarbendetektion (Multiplexing)
3.7 Berechnung der Verluste durch Austausch des Objektives
4 Ergebnisse und Diskussion
4.1 Das Bead-basierte Quantifizierungsverfahren
4.1.1 Datenverarbeitung
4.1.2 Möglichkeiten des Nachweisverfahrens
4.1.3 Limitierungen des Nachweisverfahrens
4.2 Der Hybridisierungsprozess
4.2.1 Optimierung der Beschichtungsdichte
4.2.2 Variation der Länge der capDNA Fragmente
4.2.3 Einfluss der Binderegionen von detDNA und capDNA
4.2.4 Erhöhung der Affinität durch Modifikation der capDNA
4.2.5 Einzelsträngige und doppelsträngige Ziel-Fragmente
4.3 Der Markierungsprozess (Das Reportersystem)
4.3.1 Geeignete Fluoreszenzlabel
4.3.2 Einfluss der Reporterkonzentration
4.4 Implementierung der Anforderungen für die Integration des Verfahrens in LOC-basierten POCT Systemen
4.4.1 Die integrierte LOC-Prozedur
4.4.2 Prämissen für POCT-basierte Anwendungen
4.4.3 Zusätzliche Optimierungen
4.4.4 Bewertung der elementaren Parameter
4.4.5 Detektionslimit
4.5 Multiplexing
5 Fazit und Ausblick
Literaturverzeichnis
Publikationen
Danksagung