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Titelaufnahme

Titel
Automated DNA Motif Discovery
Verfasser
Langdon, WB ; Sanchez Graillet, Olivia ; Harrison, AP
Erschienen
2010
Sprache
Englisch
Dokumenttyp
Vorabdruck
Schlagwörter
pseudogene / short and microRNAs / non-coding transcripts / systems biology / ma- chine learning / strongly typed genetic programming
URN
urn:nbn:de:0070-pub-29200151

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IIIF
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Automated DNA Motif Discovery [pdf 0.12 mb]
RIS

Klassifikation

Klassifikation (DDC) → Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke → Informatik, Wissen, Systeme → Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke

Abstract

Ensembl’s human non-coding and protein coding genes are used to automatically find DNA pattern motifs. The Backus-Naur form (BNF) grammar for regular expressions is used by genetic programming to ensure the generated strings
are legal. The evolved motif suggests the presence of Thymine followed by one or more Adenines etc. early in transcripts indicate a non-protein coding gene.

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