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Söding, Solveig Nicole: Identifizierung neuer potentieller Interaktionspartner von xIAP und Untersuchung ihrer biologischen Funktion. 2005
Inhalt
I
A
Abkürzungen
Einleitung
Apoptose
Bedeutung der Apoptose für den Organismus
Regulationsmechanismen der Apoptose
Die Funktionen von xIAP in Apoptose und Zellzyklus
Das Zwei-Hybrid-System
Das klassische Zwei-Hybrid-System
Das ‚Sos Recruitment System’ (SRS)
Das ‚Ras Recruitment System’ (RRS)
Zielsetzung
Material und Methoden
Chemikalien
Enzyme
Restriktionsendonukleasen
Polymerasen, modifizierende Enzyme, Kit’s
Inhibitoren
Antikörper
Primäre Antikörper
Sekundäre Antikörper
Sonstige Materialien
Stämme, Medien und Anzucht
Bakterienstämme
Hefestämme
Säugetierzelllinien
Medien und Anzucht
Medien für Escherichia coli
Anzucht von Escherichia coli
Medien für Saccharomyces cerevisiae
Anzucht von Saccharomyces cerevisiae
Medien für Säugetierzelllinien
Anzucht von Säugetierzelllinien
Synthetische Oligonukleotide
Plasmide
HUVEC cDNA-Bank
Titerbestimmung der cDNA-Bank:
Amplifikation der cDNA-Bank:
Transformationen/ Transfektionen
Transformation von Escherichia coli
Elektroporation
Ein-Minuten-Transformation
Hocheffiziente Transformation
Transformation von Saccharomyces cerevisiae
Schnelltransformation
Transformation mit hoher Effizienz
Transfektion von Säugetierzellen
Lipofektion
Transduktion von Säugerzellen mit TAT-Fusionsproteinen
Zwei-Hybrid-Screens
CytoTrap
RRS-Screen
DNA und RNA Präparation
Phenol/Chloroform Extraktion
Plasmid-Präparation aus Escherichia coli
DNA-Präparation aus Saccharomyces cerevisiae zur Elektropor
RNA -Präparation aus Säugetierzellen
DNA Präparation aus Agarosegelen
RT-PCR
DNARestriktionsanalyse
DNA-Ligation
PCR-Amplifikation von DNA
Auftrennung von DNAFragmenten über Agarosegele
Proteinpräparation
Proteinpräparation aus Saccharomyces cerevisiae
Proteinpräparation aus Säugetierzellen
Proteinbestimmung
Auftrennung von Proteinen über SDS-Polyacrylamidgele
Western-Blot-Analyse
In vitro Translation
Proteinherstellung aus pGEX-Vektoren
GST-Pulldown
Apoptoseinduktion bei Säugetierzellen
Wachstumsfaktorentzug in HUVEC
Apoptoseinduktion in T-Rex Zellen
Induktion von ER-Stress
Hypoxie
Mitochondrienisolierung aus Säugetierzellen
Ergebnisse
2-Hybrid-Screens
Klonierung von xIAP in den Vektor pSos und Verifikation der
Screening der HUVEC cDNA-Bank
Überprüfung der Interaktion von xIAP mit den neuen potentiel
GST-Pulldown von xIAP mit den Originalklonen aus den Two-Hyb
Transfektion von 293 Zellen mit den Klonen 3, 7-4, 15 u. 24
Immunpräzipitation von NNE und xIAP
Klonierung der Gene Tim44, mAAT, xXIP und xIAP für die Trans
Transduktion von HUVEC Zellen mit NNE-TAT
Expression der Volllängenproteine in T-Rex Zellen
Untersuchungen zur biologischen Funktion von Tim44, NNE und
Versuche zur Freisetzung von Tim44 aus den Mitochondrien
Untersuchungen zur Regulation der Expression von NNE in HUVE
Analyse der Funktionen von xXIP
Diskussion
Two-Hybrid-Screens führen zur Identifikation von sieben neue
Die Interaktion von xIAP mit Tim44, mAAT, NNE und xXIP ist i
Tim44 wird nicht aus den Mitochondrien sterbender Zellen aus
Die Expression der (-Enolase nimmt unter Hypoxie zu
Die Überexpression von xXIP schützt die Zellen vor Apoptose
Zusammenfassung
Literatur
Erklärung
Danksagung