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Bangel, Nadine: Molekulare Charakterisierung des epithelialen Na+-Kanals (ENaC) aus Nasengewebe von Patienten mit und ohne Mukoviszidose. 2006
Inhalt
Inhaltsverzeichnis
Abbildungsverzeichnis
Tabellenverzeichnis
Abkürzungsverzeichnis
1 Einleitung
1.1 Ionentransport über Epithelien
1.2 Mukoviszidose (Cystische Fibrose, CF)
1.3 Der Amilorid-sensitive epitheliale Natrium Kanal (ENaC)
1.3.1 Strukur des ENaC
1.3.2 Regulation von ENaC
1.4 Der ENaC im respiratorischen Epithel
1.5 Die Rolle von ENaC bei CF
1.6 Ziele der Arbeit
2 Material und Methoden
2.1 Gewebeproben: Menschliche Nasenpolypen
2.2 Mikrobiologische Methoden
2.2.1 Bakterienstamm
2.2.2 Plasmidvektor
2.2.3 Nährmedien und Agarplatten
2.2.4 Blau-Weiß-Selektion
2.2.5 Glycerinkultur
2.2.6 Flüssigkulturen
2.2.7 Herstellung kompetenter Bakterien
2.2.8 Transformation kompetenter Bakterien
2.3 Allgemeine molekularbiologische Methoden
2.3.1 Präzipitation von Nukleinsäuren
2.3.2 Konzentrationsbestimmung von Nukleinsäuren
2.3.3 Präparation von Plasmid-DNA
2.3.4 Restriktionsverdau
2.3.5 DNA-Gelelektrophorese
2.3.6 Lösungen für die DNA-Gelelektrophorese
2.3.7 RNA-Gelelektrophorese
2.3.8 Isolierung von DNA-Fragmenten aus Agarosegelen
2.3.9 Präparation von Gesamt-RNA aus Nasenpolypen
2.4 PCR Techniken
2.4.1 Die Polymerase-Kettenreaktion (Polymerase Chain Reaction, PCR)
2.5 PCR Techniken mit RNA
2.5.1 Reverse Transkription - Polymerasekettenreaktion (RT-PCR)
2.5.2 5`RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)
2.5.3 3`RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)
2.5.4 Semi-quantitative RT-PCR
2.5.5 Semi-quantitative Analyse der RT-PCR
2.5.6 Real-time PCR mit Sybr Green I
2.5.7 Real-time PCR Datenanalyse
2.5.8 Klonierung von PCR-Fragmenten
2.5.9 Das TOPO TA System
2.5.10 DNA-Sequenzierung und Sequenzdatenanalyse
2.6 Allgemeine proteinbiochemische Methoden
2.6.1 Proteinbestimmung nach Bradford
2.6.2 Bradford Lösung
2.6.3 Eichgerade zur Konzentrationsbestimmung von Proteinen
2.6.4 SDS-Polyacrylamidgelelektrophorese (PAGE)
2.6.5 Probenvorbereitung
2.6.6 Gelzusammensetzung (SDS-PAGE)
2.6.7 Semidry Western Blot
2.6.8 Lösungen Semidry Western Blot
2.6.9 Densitometrische Auswertung der Western Blots
3 Ergebnisse
3.1 Molekulare Charakterisierung der α-, β- und γ-hnENaC Untereinheiten aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.1.1 Überprüfung der Qualität von Gesamt-RNA
3.1.2 Molekulare Charakterisierung der α-hnENaC Untereinheit aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.1.3 Molekulare Charakterisierung der β-hnENaC Untereinheit aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.1.4 Molekulare Charakterisierung der γ-hnENaC Untereinheit aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.2 Expression der α-, β- und γ-hnENaC Untereinheiten aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.2.1 Semi-quantitative RT-PCR
3.2.2 real-time PCR
3.3 Biochemische Charakterisierung der α-, β- und γ-hnENaC Untereinheiten aus CF und nicht-CF Nasenepithel
3.3.1 Nachweis des hnENaC in CF und nicht-CF Nasenenepithel im Western Blot
3.3.2 Densitrometrische Quantifizierung der hnENaC Untereinheiten aus CF und nicht-CF Nasenenepithel
4 Diskussion
4.1 Molekulare Klonierung von hnENaC aus CF und nicht-CF Nasenepithel
4.2 Vergleich der hnENaC mRNA Expression in CF und nicht-CF Nasenepithel
4.3 Vergleich der hnENaC Protein Expression in CF und nicht-CF Nasenepithel
5 Ausblick
6 Zusammenfassung
7 Literaturverzeichnis
8 Anhang
8.1 Verwendete Chemikalien
8.2 Verwendete Geräte
8.3 Verwendete Marker und Polymerasen
8.4 Abkürzungscodes der Aminosäuren
8.5 Verwendete Primer
8.6 Nukleotid - und Aminosäuresequenz des hnENaC aus CF und nicht-CF Nasenepithel
Danksagung
Lebenslauf