Während der enchondralen Ossifikation durchlaufen die Chondrozyten regulierte Differenzierungsstadien. Die Differenzierung wird durch extrazelluläre Signalfaktoren reguliert, deren Zelloberflächenrezeptoren und durch intrazelluläre Signalfaktoren. Einer dieser Faktoren, der Transkriptionsfaktor NFIA-1, wurde genauer untersucht. Die NFI-Familie spielt eine Rolle bei der Regulation von zellulären Genexpressionen. Eine Funktion des NFIA-1 in der enchondralen Ossifikation ist noch nicht bekannt. Es konnte eine differentielle Expression des Transkriptionsfaktors NFIA-1 in kaudalen Chondrozyten nachgewiesen werden. Eine Überexpression des NFIA-1 in kranialen Chondrozyten weist auf einen negativ regulierenden Effekt auf die Hypertrophie hin. In Tibien NFIA-defizienter Mäuse zeigte sich im Vergleich zu Wildtyp-Mäusen eine intrazelluläre Matrilin 1-Färbung, sowie eine Vergrößerung der hypertrophen Zone. Demnach ist NFIA-1 ein negativer Regulator der Chondrozytendifferenzierung.