TY  - THES
A3  - Harmsen, Dag
AB  - Pseudomonaden und andere Nonfermenter (NF) sind vor allem bei immunsupprimierten Patienten häufige Infektionserreger und bereiten oft Schwierigkeiten in der konventionellen phänotypischen Diagnostik. In der vorliegenden Arbeit wurde daher für die NF-Identifizierung die kulturunabhängige partielle 16S rDNA-Gensequenzierung untersucht. Es wurde die 5´-Region der 16S ribosomalen DNA (E. coli Position 54 bis 510) sequenziert und eine Referenzsequenzdatenbank basierend auf insgesamt 76 Pseudomonas-Spezies und 48 humanmedizinisch relevanten NF-Spezies im Rahmen des Ribosomal Identification of Microorganisms (RIDOM)-Projektes etabliert. Anschließend wurde diese Referenzdatenbank mit GenBank und der kommerziellen MicroSeq 500-Datenbank verglichen. Insgesamt konnte gezeigt werden, dass die partielle 16S rDNA-Sequenzierung in den meisten Fällen eine eindeutige kulturunabhängige Identifizierung von Nonfermentern ermöglicht und RIDOM im Abgleich mit bestehenden Datenbanken sehr gut abschneidet.
AU  - Siebeneck, Mareike
AU  - Schnier, Mareike
DA  - 2008
KW  - Pseudomonas
KW  - Nonfermenter
KW  - Sequenzierung
KW  - Datenbank
KW  - rDNA
KW  - 16S
KW  - RIDOM
LA  - ger
PY  - 2008
TI  - Partielle 16S rDNA-Sequenzanalyse zur Identifizierung von Pseudomonaden und anderen medizinisch relevanten Nonfermentern
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hbz:6-95539380409
Y2  - 2024-11-22T04:04:32
ER  -