TY  - THES
A3  - Harmsen, Dag
AB  - Es wurde bereits vermutet, dass die spa Typisierung von Staphylococcus aureus evolutionsbiologisch auch ältere Prozesse darstellen kann. Das sog. „slipped-strand mispairing“ in genetischen Repeatregionen wird formal durch das sog. EDSI-Modell beschrieben. Der Algorithmus BURP gruppiert S. aureus Isolate nach den spa Repeatprofilen. In der vorliegenden Arbeit wurden für die Evaluation des Algorithmus für die phylogenetische Analyse verschiedene Datensätze untersucht. Außerdem wurden 447 Isolate mittels MLST typisiert. Im Ergebnis war die BURP-Gruppierung abhängig von den gewählten BURP-Parametern. Es ließ sich eine Konkordanz von mindestens 87% zu Referenzverfahren erzielen. Somit ermöglicht BURP auf der Basis eines einzelnen Genlocus automatische Gruppierungen von S. aureus, die mit denjenigen etablierter Gruppierungsmethoden weitgehend korrelieren. Diese Arbeit stellt auch die Grundlage für weitere phylogenetische Studien.
AU  - Berssenbrügge, Christoph
DA  - 2008
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - Typisierung
KW  - Gruppierung
KW  - klonale Verwandtschaft
KW  - spa
KW  - BURP
KW  - eBURST
LA  - ger
PY  - 2008
TI  - Evaluation des BURP-Algorithmus für die phylogenetische Analyse von Staphylococcus aureus
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hbz:6-16509591512
Y2  - 2024-11-22T01:16:09
ER  -