TY  - THES
A3  - Müller, Kai F.
AB  - Die in dieser Arbeit entwickelten Softwarekomponenten tragen zur Erhöhung der Wiederverwendbarkeit wissenschaftlicher Daten und der Reproduzierbarkeit der zugrundeliegenden Studien bei, indem sie eine eindeutige Annotation mit Metadaten (z.B. Verknüpfungen von Rohdaten oder Informationen über verwendete Methoden) ermöglichen und die übersichtliche Gegenüberstellung von Ergebnissen unterschiedlicher Methoden zum Multisequenzalignment und zur Phylogenierekonstruktion erlauben. Während die bioinformatischen Bibliotheken JPhyloIO und LibrAlign grundlegende Funktionalitäten in leicht wiederverwendbarer Form für Entwickler zur Verfügung stellen, bieten die darauf aufbauenden Anwendungen Lösungen für Endnutzer. Der Taxonomic Editor der EDIT Plattform deckt dabei taxonomische Daten ab, während PhyDE 2 und der AlignmentComporator entsprechende Funktionalität für Multisequenzalignments und ihre Metadaten anbieten. TreeGraph 2 bietet entsprechenden Funktionalität für phylogenetische Bäume und ist bereits weltweit in umfangreicher Verwendung. Alle entwickelten Komponenten sind unter http://bioinfweb.info/Software frei verfügbar.
AU  - Stöver, Ben
AU  - Stöver, Ben Christoph
AU  - Stöver, Ben C.
DA  - 2018
KW  - Metadaten
KW  - Merkmalsdaten
KW  - Multisequenzalignments, phylogenetische Bäume
KW  - bioinformatische Software
KW  - eindeutige Annotation
KW  - metadata
KW  - character data
KW  - multiple sequence alignments, phylogenetic trees
KW  - bioinformatical software
KW  - unambiguous annotation
LA  - eng
PY  - 2018
TI  - Software components for increased data reuse and reproducibility in phylogenetics and phylogenomics
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hbz:6-96159516963
Y2  - 2024-11-22T04:49:00
ER  -