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Reymann, Jürgen: Entwicklung eines SMI-Mikroskops zur Präzisions-Strukturanalyse in vitalen biologischen Systemen. 2008
Inhalt
1 Einleitung
1.1 Motivation
1.2 Stand der Technik
2 Laseroptische Mikroskopie
2.1 Klassische Beugungstheorie
2.1.1 Maxwell-Gleichungen
2.1.2 Integralformulierung von Kirchhoff
2.1.3 Beugung an einer kreisförmigen Apertur
2.2 Punktbildfunktion und Auflösungsvermögen
2.3 Optische Transferfunktion
2.4 Fluoreszenz
2.5 Höchstauflösende Mikroskopiesysteme
3 Molekulare Zellbiologie
3.1 Grundlagen der molekularen Genetik
3.1.1 Struktur der DNA
3.1.2 Genexpression
3.2 Fluoreszenzmarkierung
3.2.1 Zellfixierung
3.3 Der -Globin-Cluster
3.3.1 Evolutionäre Entwicklung
3.3.2 Struktur und Expression
3.4 Das tet-Operon
4 SMI-Mikroskopie
4.1 Theorie
4.1.1 Punktbildfunktion
4.1.2 Optische Transferfunktion
4.2 Datenakquisition
4.3 Datenanalyse
4.3.1 Axiale Intensitätsverteilung und Objektstruktur
4.3.2 Heuristischer Ansatz zur Größenbestimmung
4.4 Experimenteller Aufbau
5 Dynamische Systeme
5.1 Grundlagen der molekularen Biophysik
5.2 Markov-Prozesse
5.2.1 Grundlegende Formalismen stochastischer Prozesse
5.2.2 Brownsche Molekularbewegung
5.3 Biopolymere
5.3.1 Intramolekulare Wechselwirkungen
5.3.2 Intermolekulare Wechselwirkungen
5.4 Abschätzungen zur Mobilität
6 In-vivo SMI-Mikroskopie
6.1 Anmerkungen zur Lebendzellbeobachtung
6.2 Restriktionen
6.3 Zeitlich veränderliche Punktbildfunktion
6.3.1 Einfluss der Objektmobilität
6.3.2 Kriterien zur Vertrauenswürdigkeit der AID
7 Das Vertico-SMI
7.1 Motivation
7.2 Realisierung
7.2.1 Optische Konfiguration
7.2.2 Objektpositionierung
7.2.3 In-vivo Instrumentierung
8 Charakterisierung des Vertico-SMI
8.1 Grundlegende Eigenschaften des Systems
8.1.1 Kalibration unter Normalbedingungen
8.1.2 Einfluss von Wärme auf das System
8.2 Leistungsvermögen
8.2.1 Hochgeschwindigkeits-DAQ
8.3 Datenakquisition nicht-fixierter Objekte
8.3.1 Objektabtastung und Zeitreihen
8.3.2 Interpretation
9 Strukturanalyse biologischer Präparate
9.1 Untersuchungen zum -Globin-Lokus
9.1.1 Präparate und Durchführung
9.1.2 Resultate
9.2 Lebendzellanalysen
9.2.1 Präparate und Durchführung
9.2.2 In-vivo Signaturen
9.2.3 Einfluss der Fixierung
9.2.4 Interpretation und Hypothesen
10 Diskussion und Ausblick
10.1 Zusammenfassung
10.2 Diskussion
10.3 Perspektiven
A CAD-Modell
A.1 Basiskonstruktion
A.2 Inkubatorkammer
B Ansteuerung
B.1 Schrittmotoren
B.2 Piezoelektrische Aktuatoren
B.2.1 Kalibration des Piezo P-621.ZCD
B.3 CCD-Kamera
B.4 Datenakquisition
C Stückliste
Literaturverzeichnis
Danksagung