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Schwarzer, Christian: Expression von humanem Typ-1-Porin in Xenopus-Oozyten und Studien zu seiner Funktionalität. 2000
Inhalt
Einleitung
Material
Bakterienstämme
Eukaryontische Zellen
Tiere
Nährmedien
Medien für Bakterienkulturen
Medien für Hefekulturen
Medien für Zellkulturen
Medien für Xenopus laevis Oozyten
Lösungen und Puffer
Plasmide
Oligodesoxyribonukleotide
Oligonukleotid-Primer für Nukleotidsequenzanalysen
Oligonukleotid-Primer für Polymerase-Kettenreaktionen und Nukleotidsequenzanalysen
Enzyme, Nukleinsäuren und Antikörper
Chemikalien, Feinmaterialien und Kits
Geräte
Methoden
Allgemeine molekularbiologische Methoden
Synthese von Oligonukleotiden
Konzentrationsbestimmung von Nukleinsäuren
Polymerase-Kettenreaktion
Reinigung von PCR-Produkten
Spaltung von DNA mit Restriktionsendonukleasen
Agarose-Gelelektrophorese
Extraktion von DNA-Fragmenten aus Agarosegelen
Ligation
Klonierung von DNA-Fragmenten
Kultivierung und Konservierung von E. coli
Transformation von E. coli
Chemische Transformation nach Inoue et al. (1990)
Elektroporation kompetenter Zellen
Isolierung von Plasmid-DNA
Plasmid-Isolierung analytisch
Plasmid-Isolierung präparativ
DNA-Sequenzanalyse
Sequenzierung von DNA mit dem A.L.F.-Sequenziergerät
Sequenzierung von DNA mit dem ABI PrismTM 377-Sequenziergerät
In vitro-Transkription
Denaturierende Gelelektrophorese von RNA
In vitro-Translation
Methoden für das Two-Hybrid System
mRNA Isolierung aus H2LCL-Zellen
cDNA-Synthese
Synthese einer pMyr-cDNA Bank
Kultivierung der Hefezellen
Präparation kompetenter Hefezellen
Transformation kompetenter Zellen
Durchmusterung der H2LCL cDNA-Bank im Cyto-TrapTM Two-Hybrid System
Präparation von Plasmid-DNA aus Hefezellen
Allgemeine proteinchemische Methoden
Azeton-Fällung
Trichloressigsäure-Fällung
SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese
Proteintransfer auf PVDF-Membranen
Immunologische Detektion von Proteinen auf PVDF-Membranen
Enzymatische Detektion biotinylierter Proteine auf PVDF-Membranen
Methoden zur Expression und Isolierung rekombinanter Proteine
Präparation von E. coli BL21 (DE3) pLys [pGEX-Tctex1 oder pGEX-(PBP74]-Gesamtzellextrakten
Isolierung von rekombinantem Tctex1 und (PBP74
Überlagerungsassay
Versuche mit künstlichen Lipid-Doppelmembranen
Zellbiologische Techniken
Kultivierung von H2LCL-Zellen
Kultivierung von HeLa-Zellen
Bestimmung der Zellzahl
Transiente Transfektion von HeLa-Zellen
Indirekte Immunfluoreszenz
Kernfärbung
Fluoreszenzmikroskopie
Expression in Xenopus Oozyten
Operative Entnahme
Präparation der Oozyten
Mikroinjektion
Proteinchemische Charakterisierung heterolog exprimierter Proteine
Fluoreszenzmikroskopie
Raster-Elektronenmikroskopie
2-Elektroden Voltage clamp
Ergebnisse
Heterologe Expression von hVDAC1 in Xenopus laevis Oozyten
Konstruktion der hVDAC1-Plasmide
In vitro-Transkription und Translation
Plasmalemmale Lokalisierung der heterolog exprimierten Proteine
Lichtmikroskopische Daten
Konfokal-lasermikroskopische Daten
Rasterelektronenmikroskopische Daten
Biochemische Analyse heterolog exprimierter hVDAC1-Konstrukte
Elekrophysiologische Messungen an Xenopus Oozyten
Strom-Spannungsmessungen in modifizierter Barth’scher Lösung
Strom-Spannungsmessungen mit applizierten Modulatoren
Nachweis von hVDAC1-Interaktionspartnern im Two-Hybrid System
Konstruktion der H2LCL-cDNA Bank im Vektor pMyr
Konstruktion des pSos-Vektors mit hVDAC1
Überprüfung der hVDAC1-Wirkung auf das temperatursensitive Zellwachstum
Interaktions-Assay
Identifizierung der mit hVDAC1 interagierenden Proteine
Bestätigung der Bindungsspezifität der interagierenden Proteine
Proteinchemische Verifizierung der ermittelten Protein/Protein-Interaktionen
Expression und Aufreinigung von rekombinantem Tctex1
In vitro-Assoziation von hVDAC1 und Tctex1 im Überlagerungsassay
Expression und Aufreinigung von rekombinantem (PBP74
In vitro-Assoziation von hVDAC1 und (PBP74 im Überlagerungsassay
Lokalisierungsstudien der interagierenden Proteine in HeLa-Zellen
Kolokalisierung von hVDAC1 mit Tctex1
Kolokalisierung von hVDAC1 mit PBP74
Lokalisierung von hVDAC1 in Hela-Zellen
Funktionelle Auswirkung der Interaktionspartner auf hVDAC1
Einzelkanalgröße und Spannungsabhängigkeit von hVDAC1
Einfluß von rTctex1 auf die elektrophysiologischen Eigenschaften von hVDAC1
Einfluß von r(PBP74 auf die elektrophysiologischen Eigenschaften von hVDAC1
Diskussion
VDAC im Kontext der Mitochondrien und der Plasmamembran
Heterologe Expression in Xenopus laevis Oozyten
Fluoreszenzmikroskopische Befunde zur Expression von hVDAC1 in der Zellmembran von Xenopus Oozyten
Elektronenmikroskopische Befunde zur Expression von hVDAC1 in der Zellmembran von Xenopus Oozyten
Biochemische Bestätigung der heterolog exprimierten Proteine
Voltage clamp Messungen an Xenopus Oozyten
VDAC im Kontext von Anionen-Kanälen an der Plasmamembran
Nachweis von hVDAC1-bindenden Proteinen mit Hilfe des Two-Hybrid Systems
Charakterisierung von Tctex1
Charakterisierung von PBP74
Stand der Translokation und Lokalisierung von VDAC1
Stand der Diskussion zur Funktion von VDAC1
Ausblick
Zusammenfassung
Abkürzungsverzeichnis
Verzeichnis der Abbildungen und Tabellen
Literaturverzeichnis