Mit dem Ziel der Standardisierung und Verbesserung der Diagnostik Y-chromosomaler Mikrodeletionen startete auf Initiative des Trainingszentrums Münster der European Academy of Andrology (EAA) 1997 ein externes Qualitätskontrollprogramm (EQAS). Mit der Veröffentlichung der „Laboratory guidelines for molecular diagnosis of Y-chromosomal microdeletions” (Simoni et al., 1999) erhielten die molekulargenetisch tätigen Laboratorien eine klare Hilfestellung zur methodischen Durchführung der Diagnostik. In der vorliegenden Arbeit erfolgte die Analyse der Qualität und Zuverlässigkeit der Laborergebnisse anhand der Ergebnisse der Versuchsreihen 2000 und 2002, sowie die Einflussnahme der Leitlinien auf die Durchführung der Diagnostik und Berichterstellung. Es konnte eine Verbesserung der Spezifität und Sensitivität nachgewiesen werden. Die Leitlinien beeinflussten im gleichen Maß die Diagnostik der Erstteilnehmer als auch die der Laboratorien mit der Erfahrung einer wiederholten Teilnahme am EQAS.