Comparative fluorescence gel electrophoresis (CoFGE) was developed to improve coordinate assignment in singular experiments. The method uses an internal reference to both correct for gel-to-gel variation and allow semi-quantitation of gel spots in two-dimensional gel electrophoretic experiments (2D-PAGE). Commercial products have become available which enable users to easily perform these powerful experiments. Software capable of warping gel images is required for data analysis. A manual is provided for the use of Delta2D (DECODON) for this purpose.
Titelaufnahme
Titelaufnahme
- TitelAnalysis of CoFGE experiments with Delta2D
- Verfasser
- Enthalten inMercator Journal of Biomolecular Analysis, H. Mercator Journal of Biomolecular Analysis, S. 1-45
- Erschienen
- SpracheEnglisch
- DokumenttypAufsatz in einer Zeitschrift
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Abstract
Zusammenfassung
Die vergleichende Fluoreszenz-Gelelektrophorese (CoFGE) wurde entwickelt, um die Koordinatenzuordnung von Proteinspots in Einzelexperimenten zu verbessern. Die Methode korrigiert die Gel-zu-Gel-Variation mittels eines internen Standards, der gleichzeitig halb-quantitative Konzentrationsaussagen in zweidimensionalen gelelektrophoretischen Trennungen (2D-PAGE) erlaubt. Die Methode wurde inzwischen kommerzialisiert. Für die Datenanalyse ist Software nötig, die Gelverzerrungen ausgleichen kann. Hier wird eine Anleitung für die Anwendung von Delta2D (DECODON) für diesen Zweck bereitgestellt.
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